Կենսաինֆորմատիկա և տվյալների գիտություն
UNMCCC կենսաինֆորմատիկայի և տվյալների գիտության (BDS) համատեղ ռեսուրսը աջակցում է քաղցկեղի հիմնական, թարգմանչական և կլինիկական հետազոտություններին՝ տրամադրելով հաշվողական և վերլուծական ծառայությունների համապարփակ փաթեթ։
Այս ծառայությունները ներառում են
- հետազոտությունների նախագծում և մշակում,
- հաջորդ սերնդի հաջորդականության (NGS) տվյալների վերլուծություն,
- միաբջիջ և տարածական տրանսկրիպտոմիկա,
- քիմիական ինֆորմատիկա,
- քաղցկեղի ինֆորմատիկա, և
- առաջադեմ վիճակագրական և տվյալագիտության մեթոդաբանություններ։
ԲԴԽ անդամները սերտորեն համագործակցում են Վերլուծական և թարգմանչական գենոմիկա եւ Բիոստատիստիկա Համատեղ ռեսուրսներ՝ NGS-ից և այլ գենոմիկ և տրանսկրիպտոմիկ տվյալներից գիտելիքների ձեռքբերումը բարելավելու համար։
BDS համատեղ ռեսուրս
- ապահովում է կարևորագույն ենթակառուցվածքներ տվյալների պահպանման, բարձր արդյունավետության հաշվարկների և ամպային լուծումների համար, ներառյալ AWS ինտեգրումը NIH STRIDES ծրագրի միջոցով, և
- կառավարում է CRIIS-ը՝ եզակի քաղցկեղի տեղեկատվական հարթակ, որը ինտեգրում է կլինիկական, գենոմիկ, ուռուցքային գրանցամատյանի և սոցիալ-դեմոգրաֆիկ տվյալներ, որը մշակվել է տեղական տվյալների վերլուծական ընկերության հետ համագործակցությամբ՝ UNMCCC-ի և Նյու Մեքսիկո նահանգի աջակցությամբ։
Կենսաինֆորմատիկայի ընդհանուր ռեսուրս
Remերեմի Էդվարդս, բ.գ.թ.
համառեժիսոր
Քրիս Ամոս, փիլիսոփայության դոկտոր
համառեժիսոր
Քեթրին (Չարլի) Բրեյեր, բ.գ.թ.
Կենսաինֆորմատիկոս, տվյալների վերլուծություն
Olufunmilola (Funmi) Oyebamiji, MS
Կենսաինֆորմատիկոս, տվյալների վերլուծություն
Ինիգո Սան Գիլ, փիլիսոփայության դոկտոր
ՏՏ ծառայությունների մասնագետ
Xiangjun Xiao, MS
Ավագ տվյալների գիտնական
Այս համատեղ ռեսուրսի օգտագործումը հաստատելու համար խնդրում ենք ձեր հրատարակություններում ներառել հետևյալը.
Այս հետազոտությունը մասամբ աջակցվել է ՄԱԿ-ի Քաղցկեղի համապարփակ կենտրոնի աջակցության դրամաշնորհի NCI P30CA118100- ի և բիոինֆորմատիկայի և տվյալների մեծ չափերի վերլուծության համատեղ ռեսուրսի կողմից:
Կենսաինֆորմատիկա և տվյալագիտություն՝ հատուկ նպատակներ
Նպատակ 1. Տրամադրել տեղեկատվական, վերլուծական և գիտելիքների կառավարման աջակցություն՝ ծախսարդյունավետ ծառայությունների, տեխնոլոգիաների, սարքավորումների և փորձագիտության միջոցով՝ ՄԱԿ-ի Հակամարտությունների կոորդինատների փոխանակման ծրագրի (UNMCCC) երեք հետազոտական ծրագրերին աջակցելու համար:
ԲԶՀ-ի առաջնահերթությունն է UNMCCC անդամներին տրամադրել բարդ, բազմաչափ տվյալների վերլուծության փորձագիտության հասանելիություն և աջակցել ծրագրային ապահովմանը, հաշվողական կարիքներին և ինտեգրատիվ գիտելիքներին, որոնք անհրաժեշտ են UNMCCC-ի երեք հետազոտական ծրագրերի հետազոտական նպատակներին հասնելու համար: Գենոմիկայի, մասնավորապես տարածական գենոմիկայի առաջընթացի հետ մեկտեղ, ԲԶՀ-ն կանխատեսում է բարդ օմիկայի տվյալների վերլուծության անհրաժեշտության աճ:
ATG-ի և Biostatistics Shared Resources-ի հետ համակարգված համագործակցային մոդելի միջոցով, BDS-ը հետազոտողներին տրամադրում է ծախսարդյունավետ միջոց՝ ուսումնասիրություններ մշակելու և այնուհետև բարդ և մասնագիտացված տվյալներ վերլուծելու համար, հետազոտողներին տրամադրելով տվյալների վերլուծության մասնագիտացված մեթոդների և հնարավորությունների վերաբերյալ տեղեկատվության հասանելիություն: Բացի այդ, BDS-ը կկարգավորի UNMCCC անդամներին CRIIS-ի հասանելիությունը և կուսուցանի դրանց օգտագործումը՝ տրամադրելով խորհրդատվություն տվյալների վերլուծության և մեկնաբանման վերաբերյալ:
Նպատակ 2. Մշակել կենսաինֆորմատիկայի հատուկ գործիքներ և խողովակաշարեր, որոնք հարմարեցված կլինեն ՄԱԿ-ի Մանկական Համագործակցության Կոմիտեի հետազոտական կարիքներին։
Բժշկական հետազոտությունների կենտրոնը (BDS) կշարունակի մշակել գործիքներ, որոնք սերտորեն համապատասխանում են քաղցկեղի կենտրոնի անդամների կարիքներին, մասնավորապես՝ տարածական կենսաբանության ոլորտում: Բացի այդ, BDS-ը կարևոր դեր կխաղա CRIIS-ի օգտակարության բարձրացման գործում՝ մշակելով հիվանդների առողջական տեղեկատվության և UNMCCC-ի կողմից ստեղծված գենոմիկ տվյալների անվտանգ վերլուծության, պահպանման և բաշխման հարթակ:
Նպատակ 3. Կրթություն տրամադրել և իրազեկվածություն բարձրացնել կենսաինֆորմատիկական տեխնոլոգիաների և ծառայությունների վերաբերյալ։
ԲԶԾ տնօրենները մասնակցում են եռամսյակային լրատուին, որը լուսաբանում և բացատրում է ԲԶԾ ծառայություններն ու տեխնոլոգիաները, և օգնում են օգտատերերին բարդ կամ բազմաչափ տվյալների վերլուծություն ներառող մրցակցային դրամաշնորհային առաջարկների պատրաստման գործում: Տնօրենները մասնակցում են հետազոտական ծրագրին և UNMCCC-ի այլ հանդիպումներին՝ ԲԶԾ-ում առկա տեխնոլոգիաների և ծառայությունների վերաբերյալ փորձագիտական գիտելիքներ, խորհրդատվություն և տեղեկատվություն տրամադրելու, ինչպես նաև կենսաինֆորմատիկայի նոր մոտեցումների և մեթոդաբանությունների վերաբերյալ թարմացումներ տրամադրելու համար: Տնօրեն Էդվարդսը ակտիվորեն ներգրավված է UNM ճարտարագիտական դպրոցի կողմից առաջարկվող կենսաինֆորմատիկայի ասպիրանտուրայի ծրագրում և նաև դասախոսություններ է կարդում կենսաինֆորմատիկայի մասին ասպիրանտների հիմնական դասընթացում:
Ֆակուլտետ եւ Աշխատակազմ
Remերեմի Էդվարդս, բ.գ.թ.
Կենսաինֆորմատիկայի և տվյալների գիտության համատեղ ռեսուրսի համատնօրեն
Քիմիայի և քիմիական կենսաբանության պրոֆեսոր
Քիմիական և կենսաբանական ճարտարագիտության պրոֆեսոր
Մոլեկուլային գենետիկայի և մանրէաբանության պրոֆեսոր
Կրթություն եւ ուսուցում
Հետդոկտորական ուսուցում գենետիկայում, Հարվարդի բժշկական դպրոց
Կենսաֆիզիկայի գիտությունների թեկնածու, Կալիֆոռնիայի Սան Դիեգոյի համալսարան
Կենսաֆիզիկայի MS, Կալիֆոռնիայի Սան Դիեգոյի համալսարան
BS մեքենաշինություն, Տեխասի Առլինգտոնի համալսարան
Հետազոտական հետաքրքրությունները
Կենսաինֆորմատիկա, գենոմի տեխնոլոգիաներ, հաջորդ սերնդի հաջորդականության տեխնոլոգիա, համակարգերի կենսաբանություն, ազդանշանային ուղիների տարածական կարգավորում:
Քրիստոֆեր Ամոս, բ.գ.թ
HSC տվյալների գիտության նախաձեռնությունների ղեկավար
UNMCCC-ի բնակչության և տվյալների գիտության գծով փոխտնօրեն
Կենսաինֆորմատիկայի և տվյալների գիտության համատեղ ռեսուրսի համատնօրեն
Պրոֆեսոր, UNM ներքին հիվանդությունների ամբիոն, համաճարակաբանության, կենսաստատիստիկայի և կանխարգելիչ բժշկության բաժին
Կրթություն եւ ուսուցում
Բժշկական գենետիկայի վկայական
Հետդոկտորական վերապատրաստում, Առողջապահության ազգային ինստիտուտների միջինստիտուտային բժշկական գենետիկայի վերապատրաստման ծրագիր
Դոկտոր, կենսաչափություն և գենետիկա, Լուիզիանայի պետական համալսարանի բժշկական կենտրոն
Բիոմետրիայի և գենետիկայի մագիստրոս, Լուիզիանայի պետական համալսարանի բժշկական կենտրոն
Բակալավրի աստիճան, Ռիդ քոլեջ։
Հետազոտական հետաքրքրությունները
Դոկտոր Ամոսն իր կարիերայի մեծ մասը կենտրոնացրել է տարածված քաղցկեղի պատճառաբանության հիմքում ընկած գենետիկական և շրջակա միջավայրի ազդեցությունները հասկանալու մեթոդների մշակման և ներդրման վրա։